外阴阴道不孕的主要原因是处女膜闭锁、先天性无阴道、阴道纵隔、外阴阴道炎症等。处女膜闭锁、先天性无阴道、阴道纵隔属于女性外阴阴道先天畸形，是由于青春期后可能没有正常的月经，生殖器内经血过长，会导致输卵管积血，女性胎儿泌尿生殖隔膜发育异常引起的，无法完成性生活，无法储存精液，影响生育能力，导致女性不孕，往往需要手术治疗。
女性先天性阴道缺失，可能导致女生无法进行性生活，也不可能出现怀孕现象。
如果女孩有阴道纵隔，无论是完全性纵隔还是不完全性纵隔，都可能干扰精子活动，导致不孕。
外阴阴道炎是一种后天性疾病，由于阴道疾病导致阴道pH变化，病原微生物增加，产生过多的白细胞，进而阻碍精子的存活，降低精子活力，使精子不能顺利通过宫颈进入宫腔和输卵管，导致不孕。
如果女性过度清洁阴道，破坏阴道环境，导致阴道菌群紊乱，或不注意外阴和阴道的清洁和干燥，导致外阴炎或阴道炎，可能上升感染影响输卵管，导致输卵管炎症，导致不孕。除了月经流出的通道外，女性阴道在生育能力方面也起着容忍精液的作用。如果一些外阴阴道疾病影响精液储存，进而影响精子顺利进入女性生殖道，会因精子和卵子不能相遇而导致不孕，可称为外阴阴道不孕。
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